MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus cereus AH187 plasmid pAH187_45

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011656	TAAAA	2	10	120	129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011656	A	6	6	126	131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011656	GAG	2	6	177	182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011656	CTT	2	6	1402	1407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011656	ATG	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011656	TTTAAA	2	12	1501	1512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011656	A	6	6	1510	1515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011656	GTG	2	6	1574	1579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011656	A	8	8	1596	1603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011656	ACC	2	6	1607	1612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011656	ATT	2	6	1814	1819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011656	ATT	2	6	2518	2523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011656	AAGGG	2	10	2568	2577	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011656	ATCT	2	8	2849	2856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011656	AAT	2	6	2892	2897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011656	AAAATT	2	12	2928	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011656	AAT	2	6	2966	2971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011656	AGGG	2	8	5570	5577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011656	AGG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011656	GGA	2	6	6041	6046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011656	TCC	2	6	6064	6069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_011656	AGG	2	6	6079	6084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011656	GAA	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011656	AAGG	2	8	11734	11741	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011656	GGA	2	6	14876	14881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011656	T	7	7	18133	18139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011656	A	7	7	18143	18149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011656	TGA	2	6	18376	18381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011656	TAC	2	6	18435	18440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011656	CAAT	2	8	18550	18557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_011656	G	7	7	18575	18581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011656	GAT	2	6	18585	18590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011656	GAAA	2	8	19722	19729	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011656	GGA	2	6	19731	19736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011656	GAG	2	6	20340	20345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011656	ATG	2	6	20789	20794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011656	ATT	2	6	20812	20817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011656	CAT	2	6	20845	20850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011656	T	6	6	20850	20855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011656	T	7	7	20901	20907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011656	AT	3	6	20944	20949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011656	A	6	6	20980	20985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011656	TAAT	2	8	21006	21013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011656	AGT	2	6	21076	21081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011656	GAT	2	6	21115	21120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011656	AT	3	6	21139	21144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011656	TAT	2	6	21231	21236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011656	TAT	2	6	21245	21250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011656	TCT	2	6	21265	21270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011656	A	6	6	21448	21453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011656	A	6	6	21682	21687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011656	AGA	2	6	21706	21711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011656	AGA	2	6	21760	21765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011656	A	6	6	21795	21800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011656	TAT	2	6	21872	21877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011656	AT	3	6	21989	21994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011656	TTC	2	6	21996	22001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011656	T	6	6	22045	22050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011656	AGG	2	6	22495	22500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011656	AAG	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011656	CTT	2	6	23510	23515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011656	TCC	2	6	23651	23656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_011656	CT	3	6	24207	24212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011656	AAT	2	6	24252	24257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011656	TCC	2	6	24312	24317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_011656	TA	3	6	24336	24341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011656	TGT	2	6	24390	24395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011656	GAA	2	6	24437	24442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011656	AAT	2	6	25451	25456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011656	GAT	2	6	25519	25524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011656	CAT	2	6	25543	25548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011656	ATC	2	6	25557	25562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011656	CCT	2	6	27252	27257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011656	AAT	2	6	27262	27267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011656	ATT	2	6	27287	27292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011656	AAT	2	6	27296	27301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011656	TAAAA	2	10	27330	27339	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011656	A	6	6	27336	27341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011656	T	7	7	27425	27431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011656	GAAAA	2	10	27443	27452	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011656	TAGTTA	2	12	27475	27486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011656	ACA	2	6	27512	27517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011656	AGG	2	6	27525	27530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011656	AGG	2	6	28117	28122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011656	AGG	2	6	28391	28396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011656	TA	3	6	28854	28859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011656	A	6	6	28880	28885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011656	A	7	7	28894	28900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011656	AGT	2	6	28906	28911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011656	AATTA	2	10	28937	28946	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011656	AGG	2	6	28963	28968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011656	ATAA	2	8	28969	28976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011656	CATTAT	2	12	28987	28998	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_011656	AAAG	2	8	29350	29357	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011656	GAA	2	6	29422	29427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011656	AG	3	6	29826	29831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011656	GAAA	2	8	30072	30079	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011656	GATTT	2	10	30823	30832	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011656	AAG	2	6	31250	31255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011656	T	6	6	31324	31329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011656	A	6	6	31337	31342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011656	TTG	2	6	31390	31395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011656	TTGAA	2	10	31399	31408	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011656	A	6	6	31450	31455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011656	GTA	2	6	32012	32017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011656	AGGG	2	8	32295	32302	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011656	AAT	2	6	32647	32652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011656	CCT	2	6	32695	32700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011656	AGT	2	6	32715	32720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011656	A	6	6	32734	32739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011656	AGG	2	6	33125	33130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011656	GTT	2	6	36069	36074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011656	TC	3	6	36560	36565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_011656	T	7	7	36601	36607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011656	TCTAT	2	10	36612	36621	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_011656	T	7	7	36633	36639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011656	AACG	2	8	36678	36685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011656	CAT	2	6	36745	36750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011656	ACA	2	6	36751	36756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011656	TACA	2	8	36795	36802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011656	AT	3	6	36808	36813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011656	GAA	2	6	36857	36862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011656	AAT	2	6	36864	36869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011656	TGG	2	6	36876	36881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011656	ATG	2	6	36899	36904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011656	TCC	2	6	37480	37485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011656	TAA	2	6	37560	37565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011656	A	6	6	37606	37611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011656	AAC	2	6	37630	37635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011656	T	6	6	37638	37643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011656	TC	3	6	38343	38348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011656	TAT	2	6	38367	38372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011656	AAAAGA	2	12	38378	38389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011656	AAC	2	6	38406	38411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011656	TCTT	2	8	38412	38419	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011656	CCT	2	6	39977	39982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_011656	ATT	2	6	39987	39992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011656	T	6	6	39991	39996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011656	CA	3	6	40053	40058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_011656	T	7	7	40185	40191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011656	T	6	6	40900	40905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011656	ATTTT	2	10	41424	41433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011656	TTA	2	6	41462	41467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011656	T	7	7	41480	41486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011656	TAAA	2	8	41504	41511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011656	A	6	6	41868	41873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011656	TCA	2	6	41884	41889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011656	T	6	6	41899	41904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011656	TA	4	8	42848	42855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011656	T	6	6	42937	42942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011656	TG	3	6	42951	42956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011656	AT	3	6	43040	43045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011656	TTGAG	2	10	43053	43062	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011656	ATG	2	6	43073	43078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011656	GAGG	2	8	43089	43096	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011656	GGAATG	2	12	43108	43119	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011656	GCC	3	9	43120	43128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
158	NC_011656	T	6	6	43141	43146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011656	TTTTTC	2	12	43214	43225	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_011656	A	6	6	43239	43244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011656	AT	3	6	43257	43262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011656	ATG	2	6	43289	43294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011656	ATC	2	6	43301	43306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_011656	ATA	2	6	43399	43404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011656	TAAA	2	8	43431	43438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011656	GT	3	6	43462	43467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011656	AGA	2	6	43518	43523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011656	GAA	2	6	43567	43572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011656	A	6	6	43579	43584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011656	A	6	6	43630	43635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011656	ATTT	2	8	43659	43666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011656	TTC	2	6	43705	43710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_011656	T	6	6	43766	43771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011656	ATA	2	6	43800	43805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_011656	ATA	2	6	43811	43816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_011656	T	6	6	43872	43877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011656	ATT	2	6	43896	43901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_011656	T	7	7	43900	43906	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011656	A	7	7	44925	44931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_011656	CCT	2	6	44932	44937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_011656	A	8	8	45041	45048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_011656	T	6	6	45058	45063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_011656	TGAA	2	8	45067	45074	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
184	NC_011656	GTC	2	6	45100	45105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_011656	T	9	9	45144	45152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_011656	GTT	2	6	45153	45158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.